正常人精液中也存在异常精子，一般所占百分率低于30%，如果畸形精子百分率高于50%则称为高畸形率精子，可以导致不育。畸形精子症的病因，主要是因为精液中出现大量畸形精子反映睾丸有异常;某些药物如呋喃类可以使精子畸形率上升;精索静脉曲张可以导致畸形精子增加，典型的是双头精子;另外，一些急性疾病及物理、精神因素都有致病作用。建议明确诊断后对症治疗。
对精子形态的评价要针对整个精子：即包括头、中段和尾。精子形态大小的正常范围是：
(1)头部：头长3.5─5.0微米，宽2.0─3.0微米;精子头呈规则椭圆形。当精子头长宽分别超过5和3微米时称为大头;分别小于3和2微米时称为小头;对大小判断不明确或形态接近椭圆形都应按正常计数，因为从实际中发现只要精子其他形态参数正常，精子头大小不是重要因素。具有临床意义的精子头部异常包括：圆锥形(长宽分别小于5和2微米，或长超过5微米，宽小于3微米)、不规则形、双头和“梨形”。其中“梨形”头与牛的不育关系密切，而其对人类生育的影响尚无更多介绍，一般计在不规则形或圆锥形名下，若判断不明确仍按正常计算。
(2)中段：中段长5.0─7.0微米，宽1.0微米。宽超过2微米多反映胞浆小滴未完全退化，其对不育的影响尚不明确。如果胞浆小滴大于精子头的一半，意味着精子不成熟，属异常，若小于或等于头的一半应属正常。中段断裂也属异常。
(3)尾部：尾长45微米。尾部异常的意义尚不清楚，常见为断裂、双尾或卷曲(不包括弯曲或不对称附着)。卷曲可能与锌元素含量有关。其他缺陷可能与无症状生殖系统感染有关，因此，如果存在这一表现应作精液细菌学检查
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